Cuối thời Hán Vũ Đế, Phùng Phụng Thế do xuất thân con nhà lương gia nên được cất nhắc lên làm Lang. Thời Hán Chiêu Đế, nhờ có công nên được bổ nhiệm làm huyện trưởng Vũ An, về sau bị mất chức. Đến hơn ba mươi tuổi thì bắt đầu học sách Xuân Thu, tinh thông binh pháp, thông qua biểu tấu tiến cử của Tiền tướng quân Hàn Tăng mà được thăng làm Quân tư không lệnh. Những năm Bản Thủy (năm 73 TCN–70 TCN), đi theo bọn tướng quân Phạm Minh Hữu đánh phá Hung Nô, sau khi chiến tranh kết thúc, được phục hồi chức lang. Dưới thời Hán Tuyên Đế, từng giữ chức Quang lộc đại phu, Thủy hành đô úy. Năm đầu Nguyên Khang (năm 65 TCN), Phùng Phụng Thế thống lĩnh binh mã đến Đại Uyển, suất quân đánh phá Sa Xa, trở về triều được Tuyên Đế phong làm Hữu tướng quân Điển thuộc quốc, do Tiêu Vọng Chi phản đối nên không được phong hầu. Năm Vĩnh Quang thứ 3 (năm 41 TCN) thời Hán Nguyên Đế, nhờ có công bình định người Khương, bái làm Tả tướng quân Quang lộc huân, phong Quan Nội hầu, thực ấp năm trăm hộ, sáu mươi cân vàng, Năm Vĩnh Quang thứ 5 (năm 39 TCN), Phùng Phụng Thế ốm nặng và qua đời.